轉錄因子調控視覺化 · Transcription Factor Regulation Visualizer
DNA → 轉錄因子 → RNA 聚合酶 → mRNA → 蛋白質:看見基因表現如何被調控
拖動右側滑桿,觀察分子如何即時反應 · Drag the sliders and watch the molecules respond
① DNA
② 轉錄因子 Transcription factors
③ 轉錄 Transcription
④ 蛋白質表現 Translation
染色質 Chromatin
增強子
Enhancer
沉默子
Silencer
啟動子
Promoter
基因編碼區
Gene coding region
RNAP
RNA 聚合酶
RNA Polymerase
活化因子 A
Activator A
bound: 0
活化因子 B
Activator B
bound: 0
共活化因子
Co-activator
bound: 0
抑制子
Repressor
bound: 0
mRNA(由 RNA polymerase 轉錄產生)
Transcript
↓
核糖體
Ribosome
✓ 蛋白質完成 Protein synthesized
轉錄速率 · Transcription Rate
0
%
蛋白質表現量 · Protein Expression Level
低 Low
已產生 mRNA Transcripts
0
已產生蛋白質 Proteins
0
模型分解 · Model breakdown
baseRate(啟動子×染色質)=
0
activatorEffect(活化×增強子)=
0
repressorEffect(抑制子)=
0
transcriptionRate =
0
(clamp 0–100)
控制面板
Control Panel
調整參數,模型會即時重新計算轉錄速率與蛋白質表現量。
活化因子濃度
Activator concentration
60
抑制子濃度
Repressor concentration
20
增強子強度
Enhancer strength
60
啟動子強度
Promoter strength
55
染色質可及性
Chromatin accessibility
70
DNA 是否容易被轉錄因子接近
突變效應
Mutation effect
無 None
啟動子突變 Promoter mutation(啟動子 −60%)
增強子突變 Enhancer mutation(增強子 −70%)
抑制子結合位突變 Repressor binding site mutation(抑制 −80%)
↺ 重設為預設值 Reset
目前狀態解釋
Current state explanation
圖例
Legend
DNA
Activator A 活化因子A
Activator B 活化因子B
Co-activator 共活化因子
Repressor 抑制子
RNA Polymerase 聚合酶
mRNA
Protein 蛋白質